Hydrophyte pionnier des tourbières alcalines, le Potamot coloré est caractérisé par son écologie et ses feuilles submergées minces et translucides. On le rencontre dans les dépressions des tourbières et les eaux calmes et peu profondes des noues où il peut former de vastes herbiers. Il apprécie les eaux fraiches et pauvres en nutriments. Le Potamot coloré est classé « en danger » de disparition au niveau régional du fait de l’isolement de ses populations et de sa régression à l’échelle du bassin parisien.
Des stations de Potamot coloré sont présentes sur quelques sites de la vallée de l’Essonne, à la faveur de Noues alimentées par la nappe ou de dépressions dans les tourbières alcalines.